Khoa Phẩu thuật – Gây mê hồi sức do Bác sỹ CK II Hoàng Xuân Lý – Trưởng khoa. Với 08 phòng mổ hiện đại và khu hậu phẫu tốt nhất, bệnh viện STO Phương Đông đáp ứng đáp ứng đầy đủ các điều kiện phẫu thuật cho các bệnh lý về đường tiêu hóa, thần kinh, lồng ngực, chấn thương chỉnh hình, tai mũi họng, u bướu, phẫu thuật tạo hình thẩm mỹ, phẫu thuật mắt…

Ngoài ra, với hệ thống máy móc hiện đại, cho phép bệnh viện STO Phương Đông thực hiện được các loại phẫu thuật bằng phương pháp mổ nội soi, phẫu thuật Laser…